اداره امور آموزشی و تحصیلات تکمیلی دانشگاه مسئولیت آماده سازی و انجام پذیرش حضوری و غیرحضوری دانشجویان ورودی جدید را برعهده داشته و در طول دوران تحصیل دانشجویان بر حسن اجرای قوانین و مقررات آموزشی نظارت دارد. کلیه خدمات مرتبط با آماده سازی سیستم جامع آموزشی از قبیل ثبت نام مقدماتی، ثبت نام اصلی، ترمیم، حذف نهایی، مرخصی تحصیلی، حذف ترم و ... از طریق این اداره صورت می­پذیرد. کلیه امور دانشجویان میهمان و انتقال به دانشگاه صنعتی شیراز از طریق این اداره انجام می­شود. پس از اتمام تحصیلات هر دانشجو، روند بررسی پرونده دانش­آموختگی و صدور مدارک تحصیلی از قبیل گواهی موقت، دانشنامه و ریز نمرات فارسی و انگلیسی توسط اداره امور آموزشی و تحصیلات تکمیلی دانشگاه انجام می­شود. همچنین مکاتبات امور آموزشی مربوط به دانشجویان و دانش آموختگان بر عهده این اداره می­باشد.